老天爷好像刚开始垂青他了，98-99賽季中，马刺主客场一分小胜森林狼，获得了队史第一座冠军，独具慧眼的波波维奇接着选定了低选秀权的托尼·帕克和吉诺比利。他总是会被球员作为爸爸一样的存有，工作能力和威望得以让每名球员尊认为师。他待人接物诚挚，不容易由于一名球员技能不太好，无所作为而指责他。他更注重的是球员的质量。

和他在高校任教的情况下同样，第一年仍然不尽如人意，任教的64场赛事中只是得到了17场获胜，接着马刺在选秀大会上抽中状元签，选来啦邓肯，nba史上最牛好的大前锋。

在接着的几nba科比年，波波维奇刚开始下意识地持续他在大学打篮球的方法和情报员种类的心理战术。这个时候，一位nba名将拉里布朗早已把波波维奇放到了眼中。1994年变成了马刺主教练。到此，波波维奇的nba职业生涯正式开始了，在学了2个賽季之后，马刺队给波波维奇给出了一份五年的合同书，波波维奇已不是教练只是立即晋升球队经理。

这跨过十五年的悠长新征程，拥有几近极致的球队气氛，从马刺队史首冠到第五个冠军，波波维奇同他的球队经历了一个又一个敌人的磨炼。